过流式紫外线消毒器主体内外均采用304L或316L不锈钢材质，主体内外部抛光处理以加强紫外线光照度，确保被消毒物在消毒灭菌过程中不会有消毒灭菌不完全的情形出现。

过流式紫外线消毒器的消毒原理是利用紫外线光子的能量破坏水体中各种病毒、细菌以及其它致病体的DNA结构。主要是使DNA中的各种结构键断裂或发生光化学聚合反应，从而使各种病毒、细菌以及其它致病体丧失复制繁殖能力，达到消毒的效果。

紫外线消毒波段主要在于200～300nm之间，其中以253.7 nm波长的杀菌能力最强。当水或空气中的各种细菌病毒经过紫外线（253.7nm波长）照射区域时，紫外线穿透微生物的细胞膜和细胞核，破坏核酸（DNA或RNA）的分子键，使其失去复制能力或失去活性而死亡，从而在不使用任何化学药物的情况下杀灭水或空气中所有的细菌病毒。

由于紫外线消毒是无味的，所以紫外线消毒后不会产生对人体有害的味道。在紫外线消毒的过程中，尽量要离开室内，防止紫外线对皮肤造成伤害。

紫外线消毒技术是集光学、微生物学、电子、流体力学、空气动力学为一体，具有高效率、广谱性、低成本、长寿命、大水量和无二次污染的特点，是国际上公认的21世纪的主流消毒技术。